Resumen La neumonía sigue siendo una de las principales causas de consulta y de hospitalización a la que, además de su un alto impacto en términos de morbilidad y mortalidad, se suma la actual problemática de resistencia a los antimicrobianos, por lo que establecer directrices que permitan su adecuado diagnóstico y tratamiento es de gran importancia para obtener mejores desenlaces clínicos y promover un uso racional de antibióticos en estos pacientes. La presente guía de práctica clínica (GPC) contiene recomendaciones basadas en la evidencia para el diagnóstico y tratamiento de la neumonía adquirida en la comunidad en adultos, las cuales fueron realizadas mediante el proceso de adaptación de GPC basadas en la evidencia para el contexto colombiano.

Abstract Pneumonia continues to be one of the main causes of consultation and hospitalization to which, besides its high impact on morbidity and mortality, the current problem of antimicrobial resistance is added; thus, establishing guidelines that allow its adequate diagnosis and treatment is of great importance to obtain better clinical outcomes and promote a rational use of antibiotics in these patients. This clinical practice guideline (CPG) contains evidence-based recommendations for the diagnosis and treatment of community-acquired pneumonia in adult population; these recommendations were made by means of the process of adaptation of evidence-based CPGs for the Colombian context.

Abstract Carbapenemase-producing Enterobacterales (CPE) infections have increased in recent years. Colombia has become an endemic country for this group of microorganisms, and the infections they cause have a serious impact in terms of morbidity and mortality. The early identification of CPE carriers who are admitted to health care centers as patients is necessary to implement adequate isolation and infection control measures to limit the spread of this type of microorganisms in hospitals. Furthermore, treating these infections is a challenging task due to the limited therapeutic alternatives available and the fact that there are only a few studies proving their effectiveness in this setting. Therefore, the objective of the present work is to develop a clinical practice guideline (CPG) for the screening of patients at risk of CPE colonization and the treatment of inpatients with suspected or confirmed infections caused by this type of bacteria through a CPG adaptation process based on the ADAPTE methodology. With this purpose in mind, evidence-informed recommendations for the screening and timely identification of CPE carriers admitted to hospitals are made, as well as for the adequate pharmacological treatment of CPE infections in this context.

Resumen Las infecciones por Enterobacterales productores de carbapenemasas (EPC) han aumentado en los últimos años. Colombia se ha convertido en un país endémico para este grupo de microorganismos y las infecciones que causan tienen un impacto importante en términos de morbimortalidad. La identificación temprana de los portadores de EPC que ingresan como pacientes a las instituciones de salud es necesaria para implementar medidas de aislamiento y control de infecciones adecuadas que limiten la diseminación de este tipo de microorganismos en los hospitales. Además, el tratamiento de estas infecciones es difícil debido a las limitadas alternativas terapéuticas disponibles y la escasez de estudios que demuestren su efectividad en este escenario. Por lo anterior, el objetivo del presente trabajo es desarrollar una guía de práctica clínica (GPC) para la tamización de pacientes con riesgo de colonización por EPC y para el manejo de pacientes con infecciones, ya sea sospechadas o confirmadas, causadas por este tipo de bacterias, mediante un proceso de adaptación de GPC basado en la metodología ADAPTE. Con este propósito en mente, se hacen recomendaciones informadas en evidencia para realizar la tamización y oportuna identificación de portadores de EPC admitidos en instituciones hospitalarias, así como para el adecuado manejo farmacológico de las infecciones por CPE en este escenario.

Resumen Introducción. Staphylococcus aureus resistente a meticilina (SARM) causa infecciones graves de la piel y los tejidos blandos en los hospitales y, en los últimos años, en la comunidad. El tedizolid es una nueva oxazolidinona cuya potencia in vitro ha demostrado ser mayor que la del linezolid frente a este microorganismo. Objetivo. Conocer la actividad antimicrobiana del tedizolid y de algunos antibióticos de comparación en aislamientos de SARM causante de infecciones de piel y tejidos blandos en hospitales de Colombia. Materiales y métodos. Se hizo un estudio multicéntrico prospectivo y descriptivo a lo largo de doce meses en siete hospitales de tercer nivel de Colombia. Se recolectaron aislamientos de SARM de pacientes adultos con infección de piel y tejidos blandos. Se determinó la concentración inhibitoria mínima (CIM) mediante la técnica de ETEST® (bioMérieux) del tedizolid, el linezolid, la vancomicina, la daptomicina, el trimetoprim-sulfametoxazol y la clindamicina. Resultados. Se obtuvieron aislamientos de SARM de 102 pacientes, de los cuales 56 (54,9 %) eran hombres; el promedio de edad fue de 46,8 años. La infección tuvo origen en la comunidad en 77 casos (75,4 %). El tipo de muestra que predominó fue el absceso (69 pacientes: 67,6 %). Todos los aislamientos fueron sensibles a tedizolid, linezolid, daptomicina, trimetoprim-sulfametoxazol y vancomicina. La actividad in vitro del tedizolid fue mayor que la del linezolid. Los intervalos de la CIM del tedizolid oscilaron entre 0,125 μg/ml y 0,5 μg/ml en tanto que los del linezolid fluctuaron entre 1 μg/m y 2 μg/ml. Conclusiones. Las cepas circulantes de SARM en Colombia presentaron una gran sensibilidad al tedizolid, por lo cual sería una alternativa terapéutica para las infecciones de piel y tejidos blandos en nuestro medio.

Abstract Introduction: Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) causes severe skin and soft tissue infections in hospitals and, more recently, in the community. Tedizolid is a new second-generation oxazolidinone derivative having greater in vitro potency than linezolid against this type of microorganism. Objectives: To evaluate the antimicrobial activity of tedizolid and other comparator antibiotics in MRSA isolates causing skin and soft tissue infections in Colombian hospitals. Materials and methods: We conducted a prospective, multi-center descriptive study in seven tertiary-level hospitals in Colombia along a 12-month period. MRSA isolates were collected from adult patients with skin and soft tissue infections. Tedizolid, linezolid, vancomycin, daptomycin, trimethoprimsulfamethoxazole, and clindamycin minimum inhibitory concentration (MIC) was determined by ETEST® (bioMérieux). Results: MRSA isolates were obtained from 102 patients with an average age of 46.8 years of whom 56 (54.9%) were men. Infection was community-acquired in 77 cases (75.4%). Abscess-related samples predominated (69 patients: 67.6%). All isolates were susceptible to tedizolid, linezolid, daptomycin, trimethoprim-sulfamethoxazole, and vancomycin. Tedizolid had greater in vitro activity than linezolid. Tedizolid MIC intervals ranged from 0.125 μg/mL to 0.5 μg/mL while those of linezolid ranged from 1μg/mL to 2μg/mL. Conclusions: MRSA strains circulating in Colombia are highly susceptible to tedizolid and can be considered a therapeutic alternative for hospitals and/or community-acquired skin and soft tissue infections.

Resumen Introducción. La infección de las vías urinarias es la más frecuente en pacientes diabéticos, y es un factor determinante de la morbilidad y la mortalidad en este grupo de pacientes. El aumento de la resistencia de los microorganismos adquiridos en la comunidad a los antibióticos comúnmente utilizados para combatirla es alarmante. Objetivo. Determinar el perfil de sensibilidad a los antibióticos de los microorganismos responsables de infecciones urinarias adquiridas en la comunidad en pacientes diabéticos atendidos en algunos hospitales de Colombia. Materiales y métodos. Se hizo un estudio descriptivo de un subgrupo de pacientes diabéticos en el marco de una investigación en adultos con infección de origen comunitario de las vías urinarias. Durante un año, se recolectaron aislamientos de Escherichia coli, Klebsiella spp. y Proteus mirabilis en nueve hospitales de Colombia y se determinó su perfil de sensibilidad mediante métodos microbiológicos y moleculares, para establecer la presencia de betalactamasas de espectro extendido del tipo AmpC y de carbapenemasas del tipo KPC. Resultados. Se recolectaron 68 aislamientos (58 de E. coli, nueve de Klebsiella spp. y uno de P. mirabilis). Cuatro (6,9 %) de los aislamientos de E. coli expresaron dichas betalactamasas, en dos (3,4 %) de ellos, pertenecientes al grupo filogenético B2 y al clon ST131, se detectaron las betalactamasas TEM-1 y CTM-X-15. En otros cuatro (6,9 %) aislamientos de E. coli se encontró el fenotipo AmpC, y en tres de ellos se produjeron las betalactamasas TEM-1 y CMY-2. Un aislamiento de K. pneumoniae expresó la carbapenemasa KPC-3. Conclusión. Se confirmó la presencia de cepas productoras de betalactamasas de espectro extendido y carbapenemasas en microorganismos responsables de infección urinaria adquirida en la comunidad en pacientes diabéticos.

Abstract Introduction: Urinary tract infection is the most common pathology in diabetic patients, and an important determinant of morbidity and mortality among them. The increasing resistance of uropathogens acquired in the community to commonly used antibiotics is alarming. Objective: To identify the profile of antibiotic susceptibility of uropathogens responsible for community-acquired infections among diabetic patients in hospitals in Colombia. Materials and methods: We conducted a descriptive study in a subgroup of diabetic patients in the framework of a larger study in adults with urinary tract infection acquired in the community. Over one year, we collected Escherichia coli, Klebsiella spp. and Proteus mirabilis isolates from nine hospitals in Colombia. Their susceptibility profile was determined using microbiological and molecular methods to establish the presence of extended-spectrum AmpC betalactamases and KPC carbapenemases. Results: We collected 68 isolates (58 E. coli, nineKlebsiella spp. and oneProteus mirabilis). Four (6.9%) of the E. coli isolates expressed extended spectrum betalactamases,two (3.4%) of thembelonged to the phylogenetic group B2 andto ST131 clone and expressed the TEM-1 and CTM-X-15 betalactamases. The AmpC phenotype was found in four(6.9%) of the E. coli isolates, three of which producedTEM-1 and CMY-2 betalactamases. One K. pneumoniaeisolate expressed the KPC-3 carbapenemase. Conclusion: The presence of extended spectrum betalactamases and carbapenemases in uropathogens responsible for community-acquired infection was confirmed in diabetic patients.

Resumen Objetivo: Describir factores de riesgo asociados a infección o colonización por Acinetobacter baumannii resistente a carbapenémicos en adultos hospitalizados en unidades de cuidado intensivo (UCI) de 13 instituciones de Bogotá. Materiales y métodos: Estudio prospectivo de casos y controles. El diagnóstico de estos fue infección o colonización, con aislamientos de A. baumannii resistente a carbapenémicos y los controles de pacientes con aislamientos de A. baumannii sensibles a carbapenémico. Se incluyó a 165 personas y se hizo un aislamiento por paciente. A aquellos que presentaban A. baumannii resistente a carbapenémicos se les evaluó la sensibilidad y a todos los que presentaron A. baumannii (resistente o sensible a carbapenémicos) se les realizó detección de carbapenemasas por PCR y electroforesis en gel de campo pulsado. Resultados: Del total de aislamientos, 30 fueron A. baumannii sensible a carbapenémicos y 135 a A. baumannii resistente a carbapenémicos (83,7% fueron multirresistentes y 99% sensibles a polimixina). Todos los A. baumannii fueron positivos para OXA-51. De los A. baumannii resistentes a carbapenémicos, 129 fueron positivos para OXA-23, uno para OXA-72 y los restantes únicamente para OXA-51. Por electroforesis en gel de campo pulsado se determinaron 46 genotipos (12 clones y 34 perfiles únicos); el más grande fue Ab22 (n = 89). Del total de aislamientos, 117 correspondieron a infección y 48 a colonización. En el análisis multivariado, los factores relacionados con ABRC fueron: hospitalización previa (OR 11,9; IC 95%: 1,59-89), exposición a carbapenémicos por más de 3 días (OR 10,36; IC 95%: 1,73-61,95) y presencia de infección o colonización por genotipo Ab22 (OR 449; IC 95%: 25-798). Discusión: A. baumannii es de difícil tratamiento y erradicación del entorno hospitalario. Las medidas de prevención de infección cruzada y uso prudente de antibióticos son fundamentales para prevenir la infección por gérmenes multirresistentes en hospitales. Se identificaron 3 factores de riesgo, 2 potencialmente asociados a infección cruzada, hospitalización previa y un clon predominante, y otro relacionado con uso aumentado de carbapenémicos. Conclusión: Se identificaron 3 factores de riesgo, 2 potencialmente asociados a infección cruzada, hospitalización previa y un clon predominante, y otro relacionado con uso aumentado de carbapenémicos por más de 3 días.

Abstract Objective: To describe the risk factors for colonisation or infection by carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii in adults hospitalised in the ICU of 13 hospitals of Bogota. Materials and methods: A prospective, case control study. The case group was defined as having infection with carbapenem-resistant A. baumannii and the control group was defined as having infection with carbapenem-sensitive A. baumannii. We included 165 patients, one isolate per patient. Sensitivity was assessed in carbapenem-resistant A. baumannii and carbapenemase detection by PCR and pulsed field gel electrophoresis was performed on all patients. Results: Thirty isolates were carbapenem-sensitive A. baumannii and 135 were carbapenem-resistant A. baumannii (83.7% were multiresistant and 99% were sensitive to polymyxin). All isolates were positive to OXA-51. Of the carbapenem-resistant A .baumannii, 129 were positive to OXA 23, one to OXA-72 and the rest were positive to OXA-51. Using PFGE, 46 genotypes were identified, and the most common was Ab22 (n = 89). A total of 117 isolates were classified as infection and 48 as colonisation. Multivariate analysis determined the risk factors for carbapenem resistant A. baumannii to be: Previous hospitalisation (OR 11.9, 95% CI: 1.59 to 89), exposure to carbapenems for more than 3 days (OR 10.36, 95% CI: 1.73 to 61.95) and the presence of infection or colonisation by the Ab22 genotype (OR 449, 95% CI: 25 to 798). Discussion: A. baumannii is difficult to treat and eradicate from the hospital environment. This study identified 3 risk factors, 2 potentially associated with cross-infection (previous hospitalisation and the presence of a predominant clone) and the third was related to the use of carbapenems for more than 3 days. Conclusion: This study identified 3 risk factors, 2 potentially associated to cross-infection (previous hospitalisation and the presence of a predominant clone) and the third was related to the use of carbapenems for more than 3 days.

Resumen Introducción. Staphylococcus aureus resistente a la meticilina es uno de los agentes patógenos más frecuentes en las unidades de cuidados intensivos. Su presencia prolonga las hospitalizaciones y aumenta el riesgo de mortalidad en los pacientes con bacteriemia. Sin embargo, la etiología de este marcador de resistencia no ha sido completamente estudiada. Objetivo. Determinar los factores asociados con la aparición de S. aureus resistente a la meticilina causante de bacteriemia en pacientes atendidos en unidades de cuidados intensivos en Bogotá. Materiales y métodos. Se hizo un estudio retrospectivo de casos y controles emparejados, anidado en una cohorte de pacientes con diagnóstico de bacteriemia por S. aureus atendidos en unidades de cuidados intensivos de Bogotá entre 2006 y 2008. Los casos fueron pacientes con hemocultivo positivo para resistencia a la meticilina, emparejados 1 a 1 con controles con hemocultivos sensibles a la meticilina de la misma institución y año de hospitalización. Se analizaron mediante regresión logística condicional los factores de riesgo asociados con la presencia de resistencia, con énfasis en el tratamiento previo con antibióticos. Resultados. Se incluyeron 372 pacientes con bacteriemia por S. aureus. Factores como el uso de dispositivos previos a la hospitalización: vasculares (Odds ratio, OR=1,986; IC95% 1,038-3,801) y urinarios (OR=2,559; IC95% 1,170-5,596), así como el número de antibióticos administrado previamente, se asociaron con la aparición de resistencia. Se registró un efecto de gradiente con el número de antibióticos usados previamente, especialmente carbapenémicos. Conclusiones. El uso racional de antibióticos y la vigilancia de la exposición a procedimientos quirúrgicos o al uso de dispositivos invasivos, son intervenciones que podrían disminuir la aparición de S. aureus resistente a meticilina causante de bacteriemia.

Abstract Introduction: Methicillin-resistant Staphylococcus aureus is a frequent pathogen at critical care services. Its presence leads to increased hospital stays and mortality risk in patients with bacteremia. However, the etiology of this resistance marker has not been fully studied. Objective: To identify risk factors associated with the emergence of methicillin-resistant S. aureus bacteremia in critically ill patients treated at intensive care units in Bogotá, Colombia. Materials and methods: We conducted a retrospective paired case-control study, nested in a cohort of patients diagnosed with S. aureus bacteremia and treated at intensive care units between 2006 and 2008 in Bogotá. Cases were patients with positive blood culture to methicillin resistance, matched in a 1:1 ratio with methicillin-sensitive controls isolated from the same institution and hospitalization year. We used conditional logistic regression to analyze the risk factors associated with the presence of resistance, with emphasis on prior antibiotic therapy. Results: We included 372 patients with S. aureus bacteremia. Factors such as the use of pre-hospital devices: vascular (OR=1.986, 95% CI 1.038 to 3.801) and urinary (OR=2.559, 95% CI: 1.170 to 5.596), along with the number of previously used antibiotics, were associated with the emergence of resistance. The number of antibiotics used previously was determined to have a gradient effect, particularly carbapenems. Conclusions: The rational use of antibiotics and surveillance of exposure to surgical procedures or use of invasive devices are interventions that could diminish the emergence of methicillin-resistant S. aureus bacteremia causes.

Resumen Introducción. Pseudomonas aeruginosa se comporta como un patógeno oportunista implicado en infecciones intrahospitalarias y tiene alta capacidad de generar resistencia al manejo antibiótico. La lectura interpretada del antibiograma permite inferir estos mecanismos de resistencia y establecer el antibiótico más apropiado. Objetivo. La lectura interpretada del antibiograma busca inferir el fenotipo de resistencia de P. aeruginosa en la Fundación Hospital de la Misericordia (HOMI) entre 2006 y 2014. Materiales y métodos. Estudio descriptivo de corte transversal donde se realizó la búsqueda de informes de antibiogramas positivos para P. aeruginosa y se dedujo el fenotipo de resistencia según la lectura interpretada del antibiograma. Resultados. Se obtuvo una muestra de 463 antibiogramas positivos para P. aeruginosa aisladas de niños entre 0 y 17 años, con predominio en lactantes y preescolares de género masculino (62.2%). Los servicios de hospitalización más frecuentes fueron unidad de cuidado intensivo pediátrico (30.2%) y hospitalización general (27.3%). Los sitios de aislamiento más frecuentes fueron sangre (24.4%) y orina (23.8%). Se caracterizaron en total 11 fenotipos, los más frecuentes fueron natural (63.2%), pérdida de porina OprD (5.7%) y desrepresión parcial (8.4%) y total (8.2%) de AmpC. Conclusión. Los aislamientos de P. aeruginosa en el HOMI tienen de manera predominante un fenotipo natural. La lectura interpretada del antibiograma permitió inferir 11 fenotipos.

Abstract Introduction: Pseudomonas aeruginosa behaves as an opportunistic pathogen involved in hospital infections, with high capacity to generate resistance to antibiotic treatment. The interpretative reading of the antibiogram makes possible inferring these resistance mechanisms and establishing appropriate antibiotic treatment. Objective: The interpretative reading of the antibiogram seeks to infer the resistance phenotype of P. aeruginosa at Fundación Hospital de la Misericordia (HOMI, by its acronym in Spanish) between 2006 and 2014. Materials and methods: Descriptive cross-sectional study where a search of positive antibiogram reports for P. aeruginosa was performed. The resistance phenotype was deduced based on the interpretative reading of the antibiogram. Results: A sample of 463 positive antibiograms for P. aeruginosa was obtained; these samples were taken from children aged 0 to 17, showing a higher prevalence among infants and toddlers. The antibiograms mainly came from male subjects (62.2%). The most frequent hospitalization services were: PICU -pediatric intensive care unit- (30.2%) and general hospitalization (27.3%). The most common sources of isolation were: blood (24.4%) and urine (23.8%). 11 phenotypes were characterized, being the most common: natural phenotype (63.2%), loss of porin OprD (5.7%) and partial and full AmpC derepression (8.4% and 8.2%, respectively). Conclusion: Isolation of P. aeruginosa at HOMI predominantly shows a natural phenotype. The interpretative reading of the antibiogram allowed inferring 11 phenotypes.

Mediante un proceso de adaptación de guías de práctica clínica se seleccionaron y evaluaron guías de infección de vías urinarias en mujeres premenopáusicas no embarazadas; se identificaron 3 de alta calidad. Con base en las evidencias y las recomendaciones aportadas por estas guías, se realizó un consenso para realizar recomendaciones para personal de salud -médicos, personal de laboratorio y enfermeros- sobre el diagnóstico de las infecciones urinarias -cistitis y pielonefritis-, sus tratamientos y prevención de la recurrencia.

Using a process of adaptation, guidelines for the diagnosis, treament and prevention of urinary tract infection in premenopausal non-pregnant women were chosen and assessed. Three high quality guidelines were identified. Based on the evidence that supported these guidelines and their recommendations, a consensus was made to do recommendations for healthcare workers (physicians, laboratory personnel and nurses) on the diagnosis of urinary tract infections (cystitis and pyelonephritis), their treatment and the prevention of recurrence.

Introducción. Uno de los principales problemas de salud pública a nivel mundial son las infecciones producidas por enterobacterias resistentes a los carbapenémicos, entre las cuales Klebsiella pneumoniae es uno de los patógenos que con mayor frecuencia causa infecciones en el ámbito hospitalario. Objetivo. El objetivo del estudio fue describir la diseminación de aislamientos clínicos de K. pneumoniae productores de la enzima KPC-3 recuperados en hospitales de Bogotá. Materiales y métodos. Se analizaron 82 aislamientos de K. pneumoniae resistentes a antibióticos carbapenémicos recuperados entre el 2008 y el 2010 en 10 hospitales, a los cuales se les realizaron pruebas de detección fenotípica de enzimas por difusión de disco y microdilución, y de detección genotípica por PCR. La determinación de perfiles de sensibilidad frente a 13 antimicrobianos se realizó por métodos automatizados y manuales. La relación genética de los aislamientos se obtuvo por la técnica de PFGE. Resultados. Este estudio presenta el panorama del comportamiento de las enterobacterias resistentes a los carbapenémicos diseminadas en el curso de tres años en 10 hospitales de la ciudad, con características de resistencia a múltiples familias de antibióticos y pertenecientes a varios grupos de clones, cada uno con diferentes subtipos. Conclusiones. La diseminación de aislamientos clínicos de K. pneumoniae productores de enzima KPC-3 en Bogotá plantea la necesidad de fortalecer las acciones de vigilancia epidemiológica frente a este tipo de microorganismos y el desarrollo prioritario de actividades específicas de prevención y control de infecciones.

Introduction : One of the major worldwide public health problems today are the infections caused by carbapenem-resistant Enterobacteriaceae (CRE), among which carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae (CRKP), constitutes one of the most common pathogens causing nosocomial infection. Objective: This study was aimed at describing the dissemination of KPC-3 enzyme-producing Klebsiella pneumoniae in clinical isolates from hospitals in Bogotá. Materials and methods: Eighty-two CRKP isolates collected from 10 hospitals in Bogotá from 2008-2010 were analysed; disk diffusion and microdilution were used for phenotypic detection of enzymes and PCR for genotyping. Automated and manual methods were used for determining profiles for antimicrobial susceptibility testing (AST) with 13 agents. PFGE was used for obtaining the isolates´ genetic relationship. Results: This study gives an overview of CRKP patterns in 10 hospitals in Bogota which were found to present resistance to multiple antibiotic families. The CRKPs were grouped in different clones, each having different subtypes, and were spread in the 10 hospitals over the three-year period (2008-2010). Conclusions: The dissemination of KPC-3-producing Klebsiella pneumoniae nosocomial isolates in Bogota highlights the need for strengthening epidemiological surveillance against this type of microorganism and the development of specific priority activities for preventing and controlling such infection.

Introducción. USA300 es un linaje genético que se encuentra en aislamientos de Staphylococcus aureus sensibles (SASM) y resistentes a meticilina (SARM). Actualmente, en Colombia las infecciones por SARM en hospitales y en la comunidad son causadas principalmente por un clon con genotipo comunitario (SARM-GC) relacionado genéticamente con el clon USA300. El origen de esta variante es aún desconocido. Objetivo. Identificar y caracterizar aislamientos de S. aureus resistentes y sensibles a meticilina con el fin de aportar información para establecer un posible origen de los aislamientos SARM-GC en Colombia. Materiales y métodos. Se realizó una caracterización de aislamientos SASM relacionados con el clon USA300 detectados a partir de un análisis de 184 aislamientos de S. aureus (90 SARM y 94 SASM) causantes de infecciones. La relación genética de los aislamientos se determinó por electroforesis en gel de campo pulsado (PFGE), tipificación de secuencias multilocus (MLST) y tipificación del gen de la proteína A ( spa ). Resultados. De los 184 aislamientos, 27 (14,7 %) presentaron características moleculares y relación genética con el clon USA300, y de ellos, 18 fueron SARM y nueve fueron SASM. Todos los aislamientos SARM relacionados con este clon albergaban un casete estafilocócico cromosómico mec (SCC mec ) IVc (3.1.2). En ningún aislamiento SASM se detectaron secuencias remanentes de SCC mec o una duplicación del sitio att B que evidenciaran la pérdida del casete. Conclusión. El origen de los aislamientos SARM-GC en Colombia probablemente se encuentre en la diseminación de clones SASM relacionados con el clon USA300 que adquirieron el SCC mec IVc posteriormente.

Introduction: USA300 is a genetic lineage found both in methicillin-resistant (MRSA) and methicillin-sensitive Staphylococcus aureus (MSSA) isolates. In Colombia, hospital and community MRSA infections are caused by a USA300-related community genotype MRSA (CG-MRSA) clone. The genetic origin of this clone is unknown yet. Objective: To identify and characterize methicillin-resistant (MRSA) and methicillin-sensitive S. aureus (MSSA) isolates in order to improve the information about the origin of the CG-MRSA isolates in Colombia. Materials and methods: USA300-related MSSA isolates were detected and characterized from a study of 184 S. aureus isolates (90 MRSA and 94 MSSA) recovered from infections. The genetic relatedness of the isolates was established by means of pulsed field gel electrophoresis (PFGE), multilocus sequence typing (MLST) and protein A gene typification ( spa typing). Results: Among 184 isolates, 27 (14.7%) showed molecular characteristics and genetic relationship with the USA300 clone, of which 18 were MRSA and nine were MSSA. All USA300-related MRSA harbored Staphylococcal cassette chromosome mec (SCC mec ) IVc (3.1.2). In the MSSA isolates, SCC mec remnants or att B duplicate sites were not detected. Conclusions: In Colombia, the CG-MRSA isolates probably originated in the dissemination of an USA300-related MSSA clone which later acquired SCC mec IVc.

Introducción. La bacteriemia es una de las infecciones hospitalarias de mayor mortalidad, especialmente en las unidades de cuidados intensivos, donde es más frecuente. Pseudomonas aeruginosa es uno de los causantes de bacteriemia más agresivos. Objetivo. Evaluar la asociación entre el tratamiento antibiótico inicial y la mortalidad hospitalaria en estos pacientes. Materiales y métodos. Se trata de un estudio de cohorte retrospectivo multicéntrico realizado entre 2005 y 2008. Se consideró tratamiento adecuado aquel iniciado en las primeras 48 horas del diagnóstico que incluyera, al menos, una dosis de antibiótico intravenoso al que P. aeruginosa fuera sensible y hubiera sido suministrado en la dosis y frecuencia recomendadas. El desenlace principal fue la mortalidad hospitalaria en un lapso de 30 días. Se hizo pareo según grado de exposición usando índices de propensión y, posteriormente, análisis paramétrico de supervivencia. Resultados. Se incluyeron 164 pacientes. La mediana de edad y la clasificación del APACHE II ( Acute Physiology and Chronic Health Evaluation II ) fue de 56 y 13, respectivamente. Se identificó la fuente de la bacteriemia en 68,3 % de los casos, y la más frecuente fue el tracto respiratorio; 44 % de los pacientes recibió tratamiento inadecuado, y la resistencia bacteriana fue la principal variable asociada. La proporción de incidencia de sepsis grave, choque séptico, falla orgánica múltiple y muerte en el lapso de 30 días fue de 67,7, 50, 41,5 y 43,9 %, respectivamente. El tratamiento adecuado se asoció a una prolongación del tiempo hasta el evento (razón de tiempo ajustada, 2,95, IC 95% , 1,63 a 5,33). Conclusión. El tratamiento antibiótico inicial adecuado es un factor protector contra la mortalidad hospitalaria en pacientes con bacteriemia por P. aeruginosa .

Introduction: Among hospital-acquired infections, bacteremia is one of the leading causes of mortality worldwide, especially among intensive care unit patients, where it is more frequent. Pseudomonas aeruginosa is one of the most aggressive agents causing bacteremia. Objective: To evaluate the association between initial antimicrobial therapy and hospital mortality in these patients. Materials and methods: A multicenter and retrospective cohort study was conducted between 2005 and 2008. Antimicrobial therapy was considered adequate if it included at least one intravenous antibiotic to which the P. aeruginosa isolate was susceptible in vitro , was administered at the recommended dose and frequency for bacteremia, and initiated within the first 48 hours from diagnosis. The main outcome was 30-day hospital mortality. Patients were paired according to exposure level using propensity score matching, and then a parametric survival model was fitted. Results: One hundred and sixty four patients were included. Median age and the APACHE II score were 56 and 13, respectively. The source of bacteremia was identified in 68.3 % of cases, the respiratory tract being the most frequent. Forty-four percent of patients received inadequate therapy, with bacterial resistance as the main associated variable. The incidence of severe sepsis, septic shock, multiple organ failure and death within the first 30 days was 67.7, 50, 41.5 and 43.9%, respectively. Adequate therapy was associated with a longer time to the event (adjusted time ratio, 2.95, 95% CI, 1.63 to 5.33). Conclusion: Adequate initial antimicrobial therapy is a protective factor against hospital mortality in patients with P. aeruginosa bacteremia.

OBJECTIVE: The aim of this study was to describe the most frequently found bacterial microorganisms in bloodstream isolates taken from patients in intensive care units in Colombia and their resistance profiles. METHODS: This was a multicentre descriptive observational study that was carried out between January 2001 and June 2008 with laboratory data from 33 participating hospitals in a surveillance network. RESULTS: The most frequently found microorganisms were coagulase-negative Staphylococci 39.6%, Staphylococcus aureus 12.3%, Klebsiella pneumoniae 8.2%, Escherichia coli 5.7%, Acinetobacter baumannii, 4.0% and Pseudomonas aeruginosa 3.8%. Coagulase-negative Staphylococci registered greater than 70% oxacillin resistance rate. S. aureus presented a change in its multiresistance profile during the years of follow-up. There was a trend towards a lower resistance rate among E. coli and K. pneumoniae isolates during the study period while A. baumannii carbapenem resistance rate exceeded 50%. DISCUSSION: There has been a change in the frequency of species being isolated with a higher frequency of enterobacteriaceae compared to Gram-positive microorganisms, in general with a high resistance rate.

Introducción. La resistencia bacteriana es un problema de salud pública a nivel mundial, cuyo adecuado manejo implica el conocimiento de su presencia y comportamiento en cada uno de los países y regiones del mundo. Objetivos. Describir el perfil de resistencia a los distintos antimicrobianos marcadores en microorganismos Gram positivos identificados en hospitales colombianos. Materiales y métodos. Se realizó una revisión sistemática de la literatura indexada en Medline y Lilacs, además de la búsqueda manual de todos los números en revistas colombianas reconocidas y afines a la infectología para identificar referencias no disponibles electrónicamente. Resultados. De 34 estudios observacionales, sólo se cuenta con reportes consecutivos en años a partir del 2001, estos principalmente para Bogotá. La tasa de resistencia a la meticilina de Staphylococcus aureus y estafilococos coagulasa negativos en Bogotá, de aislamientos en servicios diferentes a la unidad de cuidados intensivos, oscilan de 35 % a 50 % y de 72 % a 76 %, respectivamente; en aislamientos de la unidad de cuidados intensivos, la resistencia osciló de 35 % a 71 % y de 74 % a 83 %, respectivamente. La tasa de resistencia a vancomicina para Enterococcus faecium en Bogotá es menor de 20 % con variaciones muy grandes con el paso de los años. Conclusiones. Hay una alta resistencia a los antibióticos marcadores en los aislamientos de Gram positivos identificados en hospitales de las principales ciudades colombianas.

Introduction. Bacterial resistance is a public health problem worldwide whose proper management requires knowledge of its presence and its behavior in each region and country. Objectives. A survey of the medical literature was conducted to identify levels of resistance to antibiotic markers in Gram positive bacterial isolates from Colombian hospitals. Materials and methods. A systematic review of the literature included articles indexed in MEDLINE and LILACS. A manual search was made of Colombian scientific journals and other infectious disease literature not available electronically. Results. A total of 34 observational studies were located, including a series of consecutive reports initiated in 2001. Most of the reports came from the city of Bogota. The rate of methicillin resistance for Staphylococcus aureus and coagulase-negative staphylococci in non intensive care unit isolates ranged between 35%-50% and 72%-76%, respectively. Resistance in intensive care unit isolates had a range between 35%-71% and 74%-83%, respectively. The rate of vancomycin-resistant Enterococcus faecium averaged less than 20% over the years but with large annual variation . Conclusions. Resistance markers appeared in high frequency among Gram positive isolates identified in hospitals in major Colombian cities.

Staphylococcus aureus es una de los principales causas de infección de pacientes en estado crítico. La información de vigilancia muestra 32,9 % de resistencia a la meticilina y una frecuencia de aislamiento como causante de infección de 12,15 % en las unidades de cuidados intensivos, especialmente infecciones del torrente sanguíneo. No se encontraron artículos de síntesis de de los datos sobre el impacto de la resistencia de esta bacteria en la mortalidad de los pacientes gravemente comprometidos. Esta revisión de la literatura resume los estudios de pronóstico sobre la infección del torrente sanguíneo por S. aureus resistente a meticilina (SARM) en pacientes de la unidad de cuidados intensivos. Se incluyeron los artículos que evaluaron la mortalidad por bacteriemias primarias o secundarias, comparándola con controles sensibles a la meticilina o infectados por otra bacteria. No se incluyeron estudios con bacteriemias polimicrobianas. De 387 referencias, seis estudios cumplieron los criterios de inclusión. Los datos disponibles no permiten generar una conclusión sobre la mortalidad relacionada con SARM en la unidad de cuidados intensivos. Los análisis bivariados muestran un incremento de la mortalidad, el cual tiende a desaparecer cuando se controla por otras variables, como el tratamiento inicial apropiado y la gravedad del cuadro clínico. La participación de este microorganismo en la mortalidad de pacientes de la unidad de cuidados intensivos y sus determinantes, permanecen aún sin explicar.

Staphylococcus aureus is an important infectious pathogen in critically ill patients. Local surveillance shows its isolation as infectious causative pathogen at intensive care units in 12.15% of cases and a methicillin resistance rate of 32.9%, specially related with bloodstream infections. This review summarizes available prognosis studies related to methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) bloodstream infections at intensive care unit (ICU). References with primary or secondary bacteremia patients compared with susceptible pathogen controls or different pathogen were included. Polymicrobial bacteremias were not included. 387 references were retrieved, only six studies met the inclusion criteria. The available evidence does not support a definitive conclusion about MRSA-related mortality in ICU. Increased mortality registered in bivariate analysis disappears when other covariates as appropriate initial therapy and baseline severity are adjusted. The involvement of this marker in ICU patient´s mortality and their prognosis determinants still remain unexplained.

Objective Determining the prevalence of methicillin-resistant Staphylococcus aureus (CA-MRSA) and susceptibility to erythromycin and clindamycin (resistance profile suggestive of being CA-MRSA) in community isolates from de GREBO's database from 2001-2005. Materials and Methods GREBO's database has been complied since 2001, using more than 22 hospitals in Bogota. S. aureus resistance profiles were determined from community isolates. Whonet 5.3 software and CLSI breakpoints (2003) were used. Results 2 308 S. aureus community isolates were identified. 618 (26,8 %) were methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA). 74 (3,2 %) MRSA exhibited susceptibility to all other antibiotics (erythromycin, clindamycin), suggesting that S. aureus belonged to CA-MRSA. Conclusions CA-MRSA might have emerged in Bogotá thereby having a profound implication for public health due to possible dissemination in the community and because antibiotic protocols for emergency settings should be changed. The results of our study suggested that CA-MRSA could be more common in Bogotá than currently expected.

Objetivo Determinar la prevalencia de Staphylococcus aureus resistente a meticilina y sensible a eritromicina y clindamicina (perfil de resistencia sugestivo de ser adquirido en la comunidad) (SARM-AC), de aislamientos ambulatorios de la base de datos de Grebo durante el periodo 2001-2005. Materiales y Métodos La base de datos del grupo Grebo se integró desde 2001 con más de 22 hospitales participantes en Bogotá. A partir de esta base de datos y con la ayuda del programa Whonet 5.3, se determinaron los perfiles de resistencia de los aislamientos ambulatorios de S.aureus. Se tomaron los puntos de corte establecidos por la CLSI (2003). Resultados Se identificaron 2 308 aislamientos de S. aureus provenientes de aislamientos ambulatorios, de los cuales 618 (26,8 %) eran Staphylococcus aureus meticilino resistente (SARM). Setenta y cuatro (3,2 %) de éstos, presentaban sensibilidad a todos los otros antibióticos (eritromicina, clindamicina), sugestivos de corresponder al fenotipo SARM-AC. Conclusiones La presencia en Bogotá de aislamiento de S. aureus sugestivos de tener el perfil de SARM -AC, implica un gran problema de salud pública debido a su posibilidad de diseminación en la comunidad y cambios en el empleo de antibióticos en los servicios de urgencias. Los datos de nuestro estudio sugieren que los aislamientos de SARM-AC en nuestro medio, pueden ser más comúnes de lo que pensamos.